111推動相互承認協議可有利於減少不必要之貿易障礙，便利綠色產品之國際流通。因此環境與發展基金會曾陸續與加拿大、美國、泰國、韓國、澳大利亞、日本、烏克蘭、紐西蘭與捷克完成相互承認協議之簽署。
111環境與發展基金會與美、加所簽署之協議，屬於全面性承認，即（1）承認對方之測試標準與測試報告，（2）承認對方之稽核驗證報告，（3）如對方之規格標準與我方相似或甚至更為嚴格時，承認對方之規格標準。與日、泰、韓、澳大利亞、紐西蘭所簽署者，則僅含第（1）項與授權對方代我方執行稽核驗證。此外由於環境與發展基金會刻正積極推動共同性核心規格標準之開放，故未來只要任何國家之標章組織願意採用某項產品之共同性核心規格標準，便可與其他國家執行組織簽署相互承認協議。
111而為提升GEN會員間之瞭解，以降低簽訂相互承認時之阻力，環境與發展基金會于總經理目前致力推動『全球同步之環保標章系統』（International Coordinated Ecolabelling System，GENICES）其中最關鍵之兩個工作為（1）推動多邊相互信任（Multilateral Mutual Trust，MMT）機制及（2）開發共同核心標準（Common Core Criteria，CCC）。經過GEN工作小組多次討論，決定在經費有限之情況下，宜以第（1）項工作為最優先。第（1）項工作將由環境與發展基金會與紐西蘭標章執行組織（New Zealand Ecolabelling Trust，NZET）率先擔任示範單位，依據查核表（此查核表係將ISO 14024與ISO/IEC Guide 65兩項標準綜合並予簡化而成）填寫作業模式，以證明是否具獨立公正性，是否已建立品質管理系統，是否符合第一類環保標章制度原則等。推動MMT之最終目的在促進相互承認。
94年11月環境與發展基金會與紐西蘭環保標章組織(New Zealand Ecolabelling Trust)成為全球環保標章組織通過多邊相互信任（Multilateral Mutual Trust，MMT）機制之首例。
111為持續跨大參與GENICES之組織數目，2006度GEN工作小組繼續派員赴加拿大Terrachoice公司與瑞典之SSNC (Swedish Society for Nature Conservation )，該二組織亦皆通過GENICES之同儕認證，故目前已有四個組織完成多邊相互信任（Multilateral Mutual Trust，MMT）機制。此外，於本年度與捷克簽訂相互承認協議之過程中，環境與發展基金會已協助捷克環保標章組織建立完整之文件架構，故環境與發展基金會于總經理亦鼓勵捷克環保標章組織於2007年提出GENICES申請。

目前世界各國環保標章組織間相互承認架構概列如下：